La oferta educativa del IES Cantillana comprende los siguientes niveles de enseñanza:
- ESO
El número total de grupos de la ESO en los últimos cursos fluctúa entre 16 y 17 grupos. Prácticamente todo el alumnado de esta enseñanza procede de los dos CEIP de la localidad, los cuales son centros adscritos al 100% al IES.
- Programa para la Transición a la Vida Adulta y Laboral (PTVAL)
Programa para desarrollar capacidades de autonomía personal, integración social y formación laboral, que puede ser en distintos campos profesionales. Destinado a alumnado con NEE, que tengan cumplidos 16 años o los cumpla durante el año natural en que se inicia el programa.
- Educación Básica Especial
Desde el curso 2012-13, el IES Cantillana cuenta con un aula específica de Educación Especial. Este alumnado procede del aula específica del CEIP La Esperanza.
- Formación Profesional Básica Específica
En el curso 2021-22 se implantó el primer curso del Programa Específico de Formación Profesional Básica en Servicios Administrativos. En el curso 2022-23 se continuó con la implantación del segundo curso.
- Bachilleratos
Las dos modalidades de Bachillerato que se imparten en el IES Cantillana son: Humanidades y Ciencias Sociales y Ciencias.
- Ciclos Formativos
Los Ciclos Formativos que se imparten en el IES Cantillana son:
• Formación Profesional Básica de Informática y Comunicaciones.
• Formación Profesional de Grado Medio de Gestión Administrativa.
• Formación Profesional de Grado Medio de Sistemas Microinformáticos y Redes.
• Formación Profesional de Grado Superior de Administración y Finanzas.
• Formación Profesional de Grado Superior de Desarrollo de Aplicaciones Multiplataforma.
- Nivel II ESA Semipresencial
Desde el curso 2010-11 se imparte en el IES Cantillana el Nivel II de Esa Semipresencial. Este centro tiene adscritos tres SEPER: el SEPER Curro Jiménez de Cantillana, el SEPER La Madroña de Burguillos y el SEPER Siete Arroyos de Castilblanco de los Arroyos. Estos tres SEPER dependen del CEPER Cerro Macareno de San José de La Rinconada.